正规POS机个人刷卡1000元所扣的手续费，主要取决于POS机的类型、支付方式以及支付机构或银行的具体政策。以下是根据不同情况对手续费的具体分析：

一、借记卡（储蓄卡）

1. 标准费率：通常为交易金额的0.5%左右，但设有封顶限制，一般为20元。
2. 手续费计算：1000元 * 0.5% = 5元。由于5元低于封顶限制20元，因此实际手续费为5元。

二、信用卡

1. 标准费率：通常在0.6%左右，但可能因商户类型、交易金额、合作模式等因素有所调整。
2. 手续费计算：1000元 * 0.6% = 6元。信用卡交易通常没有封顶限制，因此实际手续费为6元。

三、扫码支付

1. 标准费率：通常为交易金额的0.38%左右，但部分支付机构或银行可能有特殊费率或封顶限制。
2. 手续费计算：1000元 * 0.38% = 3.8元。如果支付机构或银行没有设置封顶限制，则实际手续费为3.8元。但需注意，部分情况下扫码支付可能有特殊费率或优惠活动。

四、特殊情况

1. 优惠活动：支付机构或银行为了吸引客户，可能会推出一些优惠活动，如降低费率、免手续费等。因此，在实际使用中，手续费可能会低于上述标准费率。
2. 秒到费用：部分POS机可能会收取秒到费用，即交易资金实时到账所需支付的费用。这部分费用通常不是由支付机构或银行直接收取，而是由POS机代理商或服务商收取。具体金额和收取方式可能因代理商或服务商的不同而有所差异。

综上所述，正规POS机个人刷卡1000元所扣的手续费可能在3.8元至6元之间，具体金额取决于POS机的类型、支付方式以及支付机构或银行的具体政策。为了获取最准确的手续费信息，建议直接咨询支付机构或银行的客服人员或查看相关政策文件。